Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCEA2Q15560 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms