Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms