Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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