Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms