Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
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GRIN2AQ12879 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
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GRIN2AQ12879 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
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GRIN2AQ12879 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
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GRIN2AQ12879 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
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GRIN2AQ12879 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2AQ12879 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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