Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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CNTN1Q12860 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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