Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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