Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC6Q03468 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms