Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDR2Q01850 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms