Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPCAP84074 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPCAP84074 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAP84074 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAP84074 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms