Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms