Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms