Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1A1P48729 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms