Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 HCCAT5-202ENST00000642127 1029 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC022486.1-201ENST00000510613 1483 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 NDUFB5-205ENST00000472629 744 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC116345.1-202ENST00000513379 941 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 GK-AS1-201ENST00000464659 651 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AP3M2-205ENST00000517922 1094 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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HOXD11P31277 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC136285.1-201ENST00000566092 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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