Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SDSP20132 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SDSP20132 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SDSP20132 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SDSP20132 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SDSP20132 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SDSP20132 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SDSP20132 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SDSP20132 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SDSP20132 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SDSP20132 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SDSP20132 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SDSP20132 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SDSP20132 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SDSP20132 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SDSP20132 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SDSP20132 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SDSP20132 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SDSP20132 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SDSP20132 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SDSP20132 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SDSP20132 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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