Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCAP17252 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms