Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms