Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3P10147 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms