Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI4P10075 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GLI4P10075 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GLI4P10075 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GLI4P10075 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GLI4P10075 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GLI4P10075 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GLI4P10075 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms