Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms