Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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