Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms