Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms