Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms