Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms