Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms