Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOPXQ9BPY8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOPXQ9BPY8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOPXQ9BPY8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms