Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms