Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms