Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms