Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms