Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms