Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CA9Q16790 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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