Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18Q15532 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18Q15532 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18Q15532 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18Q15532 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18Q15532 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18Q15532 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18Q15532 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18Q15532 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SS18Q15532 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SS18Q15532 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SS18Q15532 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SS18Q15532 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SS18Q15532 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SS18Q15532 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms