Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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