Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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