Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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