Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms