Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms