Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms