Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms