Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD53P19397 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms