Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms