Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCO2O43819 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCO2O43819 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCO2O43819 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCO2O43819 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCO2O43819 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCO2O43819 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCO2O43819 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCO2O43819 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCO2O43819 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCO2O43819 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCO2O43819 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCO2O43819 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCO2O43819 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCO2O43819 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms