Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms