Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms