Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
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BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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BIVM-ERCC5R4GMW8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
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BIVM-ERCC5R4GMW8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
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BIVM-ERCC5R4GMW8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
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