Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms