Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PADI4Q9UM07 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI4Q9UM07 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI4Q9UM07 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI4Q9UM07 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI4Q9UM07 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI4Q9UM07 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI4Q9UM07 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI4Q9UM07 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI4Q9UM07 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI4Q9UM07 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI4Q9UM07 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI4Q9UM07 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms