Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms